治疗脑炎的常用药物如下：
注射用盐酸吡硫醇22种
本品用于脑外伤后遗症、脑炎及脑膜炎后遗症等引起的头晕胀痛、失眠、记忆力减退、注意力不集中、情绪变化等症状的改善；亦用于改善脑动脉硬化、老年痴呆性精神症状。
注射用单磷酸阿糖腺苷38种
用于治疗疱疹病毒感染所致的口炎、皮炎、脑炎及巨细胞病毒感染。
盐酸吡硫醇片111种
本品适用于脑外伤后遗症、脑炎及脑膜炎后遗症等的头晕胀痛、失眠、记忆力减退、注意力不集中、情绪变化的改善；亦用于脑动脉硬化、老年痴呆性精神症状等。
莪术油注射液19种
用于病毒引起的感冒、上呼吸道感染、小儿病毒性肺炎；消化道溃疡，甲型病毒性肝炎，小儿病毒性肠炎及病毒性心肌炎、脑炎等。
脑蛋白水解物注射液149种
1.脑外伤后遗症2.脑炎及脑膜炎后遗症3.神经官能症、脑神经衰弱失眠4.神经性头痛5.动脉硬化引起的脑萎缩6.儿童大脑发育不全7.美尼尔氏综合症8.精神分裂症
清热解毒颗粒15种
清热解毒，养阴生津，泻火。用于风热型感冒，流行性腮腺炎及轻，中型乙型脑炎。
转移因子胶囊8种
转移因子胶囊临床可用于辅助治疗某些抗生素难以控制的病毒性或霉菌性细胞内感染(如带状疱疹、流行性乙型脑炎、白色念珠菌感染、病毒性心肌炎等)；对恶性肿瘤可作为辅助治疗剂；免疫缺陷病(如湿疹，血小板减少，多次感染综合症及慢性皮肤黏膜真菌病有一定的疗效)。
醒脑静注射液8种
清热泻火，凉血解毒，开窍醒脑。用于流行性乙型脑炎、肝昏迷，热入营血，内陷心包，高热烦躁，神昏谵语，舌绛脉数。
复方大青叶注射液13种
清瘟解毒。用于乙型脑炎，急、慢性肝炎，流行性感冒，腮腺炎。
多巴丝肼片1种
用于治疗帕金森病、症状性帕金森综合症(脑炎后、动脉硬化性或中毒性)，但不包括药物引起的帕金森综合症。
巴特日七味丸4种
清瘟解毒，消“粘，止痛，散瘀，止痢。用于瘟疫盛热，脑炎，赤白痢疾，白喉，目黄，音哑，转筋。
转移因子口服溶液13种
用于治疗某些抗生素难以控制的病毒性或霉菌性细胞内感染（如带状疱疹，流行性乙型脑炎，白色念珠菌感染，病毒性心肌炎等）；对恶性肿瘤可作为辅助治疗剂（主要用于肺癌，鼻咽癌，乳腺癌，骨肉瘤等）；免疫缺陷病（如湿疹，血小板减少，多次感染综合症及慢性皮肤粘膜真菌病有较好的疗效）。
