随着检查方法的研究深入，新生儿胃镜检查得以在临床开展和应用。国外早在70年代末就开展了新生儿胃镜检查，我国起步较晚。目前新生儿胃镜检查的适应证，主要是不明原因的上消化道出血的诊断和一般治疗效果不佳的上消化道出血的内镜下治疗。从成人胃镜检查资料显示，胃镜检查能及早发现病变，明确病变性质。新生儿胃镜检查也不例外，有资料显示，新生儿胃镜检查阳性率高达90%，说明在上消化道出血的新生儿进行胃镜检查是必要的，通过胃镜检查明确了病变部位、性质和程度，为诊断和治疗提供可靠的依据。
新生儿胃镜检查的禁忌证，处于休克、昏迷等危重状态的患儿；安静未吸氧下，动脉血氧饱和度90%或心率160次/min及100次/min；疑有胃肠穿孔者。
检查方法一般采用纤维胃镜，术前一般不需用药，术前应禁食至少4小时，有窒息史的患儿，应延长至6小时以上，一般不需洗胃。应选取外径不超过7.9m加的纤维胃镜，检查时要求技术熟练、动作轻柔、不要强行插管。
新生儿胃镜检查的常见并发症是心肺功能紊乱，表现为心率增快或减慢，血氧饱和度下降，出现低氧血症。心率的改变主要是由于检查过程中刺激了迷走神经所致，因此，当血氧饱和度低于80%时应给予面罩吸氧，一般能很快的好转，如半分钟后动脉血氧饱和度达不到85%，应及时停止胃镜检查。此外，如操作不当，可引起器械损伤。总之，新生儿胃镜检查应严格掌握适应证，及时发现并发症和给予相应的处理。
